「病毒基因定序」為何重要?3種強大作用一次看懂

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NGS大量解碼病毒基因序列,建立病毒各自身份標籤,這些資訊能幫助我們追蹤、預防變種病毒的傳播。

這個工具不但能抓出感染的病毒是哪種變異種類,還可以 ... 關閉 新冠肺炎 即時 展開子選單 即時首頁 熱門 政治 生活 社會 娛樂 體育 財經 國際 兩岸 科技 軍事 健康 專輯 政治 展開子選單 政治首頁 總覽 言論 展開子選單 首頁 總覽 中時社論 旺報社評 工商社論 快評 時論廣場 尚青論壇 兩岸徵文 史話 海納百川 無色覺醒 生活 展開子選單 生活首頁 總覽 玩食 消費 時尚 專輯 新冠肺炎 校園Campus 娛樂 展開子選單 娛樂首頁 總覽 華人星光 哈燒日韓 西洋熱門 綜合星聞 專輯 財經 展開子選單 財經首頁 總覽 要聞 證券 金融 產業 股市 國際 展開子選單 國際首頁 總覽 政治圈 開眼界 美大選 專輯 兩岸 展開子選單 兩岸首頁 總覽 政經 社會萬象 社會 展開子選單 社會首頁 總覽 刑案 地方萬象 法庭中心 軍事 展開子選單 軍事首頁 總覽 專輯 科技 展開子選單 科技首頁 總覽 行動裝置 電腦硬體 網際網路 電玩娛樂 專輯 體育 展開子選單 體育首頁 總覽 高爾夫 棒球 籃球 足球 其他 專輯 時來運轉 網推 展開子選單 網推首頁 總覽 萌寵 搜奇 歷史 有影 展開子選單 有影首頁 總覽 中天新聞 中視新聞 政新鮮 街頭大聲公 玩FUN飯 旗開得勝 無色覺醒 追劇 健康 展開子選單 健康首頁 總覽 新聞快遞 名醫名家 養生健體 醫病百科 中醫健康 心靈關係 健康專輯 健康規劃局 運勢 展開子選單 運勢首頁 總覽 星座 生肖 風水 寶島 展開子選單 寶島首頁 總覽 台北基宜花 新北金馬 桃園竹苗 台中彰投 台南雲嘉 高雄屏東澎 孝親報報 特定工廠 汽車 房產 首頁 健康 常聽到的「病毒基因定序」為何重要?3種強大作用一次看懂。

(示意圖/Shutterstock) Facebook Messenger Line Weibo Twitter Telegram 複製連結 字級設定:小中大特 臺灣於今年(2021年)7月起實施入境臺灣全面PCR檢測,若採檢結果發現確定感染新冠病毒,還必需進行病毒基因定序。

基因定序為什麼重要?在防疫上又扮演什麼樣的角色?這都關係到新冠疫情不斷出現的新變種病毒與感染形式。

常見的PCR檢測技術,是檢測身體內是否有病毒的核酸序列,我們常聽到的PCR檢測結果陽性,就表示受到新冠病毒感染。

現今造成全球大流行的新冠疫情不斷出現新的變種病毒,更產生越來越高的傳染力與致病力。

●Delta變種病毒來勢洶洶!臺灣準備好了嗎? Delta變種病毒起源於印度,它的傳染力比Alpha變種高出40-60%,至今Delta幾乎成為全球的主流病毒株。

亞洲方面,日本已有高達近9成感染者受Delta病毒感染,韓國染疫者因Delta病毒感染也佔7成。

美國衛生部(HHS)表示因Delta病毒造成住院人數不斷增加,嚴重感染族群更擴散至12歲以下未施打疫苗的兒童。

此外,在中南美洲不斷擴散的Lambda變種病毒,也於2021年8月15日首度在菲律賓出現本土案例,顯示Lambda變種已入侵亞洲的警訊。

在變種病毒肆虐的情況下,PCR雖然比快篩準確率高也能大量篩檢,但要確認感染到哪種變種病毒,只有PCR還是不夠。

這時候,基因定序就能發揮強大的作用,它能大規模解碼基因資訊,不僅能確認病毒種類,即時檢測出新的突變病毒,不論是Delta變種或其他未知的變種病毒都能被精準監控。

此外,基因定序也能用來推論病毒突變過程,清楚掌握病毒的演變模式。

●新的次世代定序技術(NextGenerationSequencingNGS) NGS大量解碼病毒基因序列,建立病毒各自身份標籤,這些資訊能幫助我們追蹤、預防變種病毒的傳播。

這個工具不但能抓出感染的病毒是哪種變異種類,還可以透過基因序列比對確認感染者是被誰感染,也就是說用基因定序來疫調,讓傳播鏈無所遁形,全面防堵變種病毒的擴散。

PCR與NGS-基因定序關係(圖/基因線上提供) 國家衛生研究院蔡世峰特聘研究員在新冠病毒的全基因體定序上有豐富經驗,他表示若能做到將快篩和PCR陽性檢體加做NGS基因定序,所得到的病毒資訊會更完整,對於推論病毒突變和疫苗研究發展上助益很大。

●NGS基因定序的三大作用:病毒從哪來?往哪去? 1.溯源與追蹤傳播鏈 在防疫初期,對病毒所知不多的情況下,只能透過症狀或接觸史推論感染源,但新冠患者的症狀很多樣,有的甚至是無症狀者。

又比如前陣子台灣爆發本土疫情,同時發生諾富特與宜蘭群聚案件,很難斷定確切感染源頭,如果只靠PCR或快篩沒辦法建立傳播鏈。

而病毒的全基因體定序,就像建立它的身分證字號,了解風險源頭後才能防堵傳染;比起從「症狀」追病毒,從「基因表現」下手更可以有效控制疫情。

2.偵測突變病毒 隨著病毒逐漸在全球傳染蔓延,不斷出現難以預測的突變病毒,這也使得在評估疫苗有效性的考量上,「防範變種病毒」能力成為一個重要指標。

例如國內首度獲得緊急使用授權(EUA)的高端疫苗,審查委員也在會議中強烈提出需要補上對於Delta變種病毒的長期保護數據;日前申請EUA未獲准的聯亞疫苗,也正準備以抗Delta變種試驗提出進一步申訴,說明對抗變種病毒是當今疫苗保護力相當的重要一環。

面對不斷演變的新冠病毒,基因定序能夠在變種病毒一出現時,就即時確定它的種類,避免傳染擴散。

另外,偵測新突變的病毒,也讓科學家可以推斷將來可能的感染途徑,是研發疫苗、藥物與預防感染的重要基礎。

3.防疫措施的基礎 由於基因定序可以大量篩檢確認病毒種類,以及掌握在一個特定群體中,總共感染人數、以及不同病毒種類的盛行率,政府與防疫單位能基於這些資訊採取應對措施,針對不同的病毒株做超前部署。

以Delta變種病毒來說,2021年6月底臺灣首例感染案例出現在屏東,群聚案17人之中有高達15人都是感染Delta變種。

更危險的是,感染Delta變種具有引發慢性新冠症候群(longCOVID-19)的風險,如果沒有在確診時就確認病毒類型並嚴防傳染,慢性新冠症候群長時間的恢復期都帶有傳染風險,會造成公衛上很大的破口。

因此持續透過基因定序確定病毒種類,並採取相應防疫措施顯得格外重要。

(圖/基因線上提供) ●三大COVID-19病毒檢測方法的差異 現有COVID-19病毒檢測方法可分為3大類,精準度由低到高分別是抗原快篩、PCR核酸檢測、NGS基因定序。

1.抗原快篩 快篩主要的目的是快速分流出感染者,由於採檢後約10-30分鐘就可完成,效率相當高、價錢便宜適合大量篩檢,快速找出病毒是否已在族群存在。

但也因為精準度較低,容易出現偽陰性、偽陽性的誤判情形,因此後續一般會搭配PCR核酸檢測作確認。

抗原快篩的原理,是用設計過的抗體和病毒的蛋白質配對,如果符合,就會像鑰匙與鎖頭一樣互補,也代表著受試者已經被病毒感染。

2.PCR核酸檢測 PCR核酸檢測是目前全球判斷染疫的標準方式。

它的原理是用新冠病毒的一小段核酸片段,看採樣的檢體中是否能偵測到相同的片段,以及感染的病毒量,藉以判斷感染程度的標準依據。

這項技術需要專業人員與實驗室設備操作,約需4小時才能得知結果。

PCR檢測的好處是相較於抗原快篩精準度來的高,即使病毒量低也可以驗出。

3.NGS次世代基因定序 有別於PCR看病毒一小片段核酸確認有沒有感染,NGS基因定序會把病毒所有的基因分析出來,不僅可以知道感染者體內確切的病毒種類,還可以透過大規模比對變種病毒的特性,預測病毒的演變趨勢,如以一來能在新的變種病毒出現之前,就先做好預防措施。

目前全球有許多檢測設備公司投入NGS技術監控變種病毒,包括Illumina、ThermoFisherScientific、Qiagen。

其中,全球第一個新冠病毒基因體即通過Illumina平台定序解密,這項突破大幅推進PCR檢測與疫苗研發的速度。

Illumina的NGS定序也是目前全球使用最廣泛檢測設備,各國科學家正借助Illumina的技術持續解碼新冠病毒的各變種基因序列,只有在不斷累積這些基因資訊、增加對病毒瞭解的前提下,才能更有效監測變種病毒。

COVID-19-檢測技術比較。

(圖/基因線上提供) ●NGS除了能定序病毒基因,在精準醫療也扮演重要角色 NGS基因定序是重要的防疫功臣,事實上,它還能在將來疾病監控領域貢獻更多。

NGS解碼的基因訊息除了是變種病毒演化的動力,遺傳訊息也主導人類許多疾病的發展,能從基因層次及早確定患病風險,可以更有效控制疾病與使用適合的療程。

例如,「精準醫療」強調依據每個病患的基因變異,給予病患個人合適的藥物與治療方式。

在癌症治療領域,NGS定序可有助確認癌症發生與多重基因突變的關係。

另外,開發標靶藥物也仰賴NGS定序,才能精準找出導致疾病的基因突變有哪些。

與疾病抗戰是場長久戰役,不論面對新興變種病毒,或我們早已熟悉的癌症,NGS基因定序都會繼續扮演重要的前線戰士。

文章來源:本文由《基因線上》授權報導,未經同意禁止轉載,點此查看原始文章 莫德納疫苗產生的抗體數超越輝瑞!比利時研究:至少2倍 牛津大學研究:COVID-19引發血栓的機率遠高於AZ疫苗 Delta入侵社區升三級?陳時中:未達升級條件 埃及爸是破口?台大醫曝最壞狀況嘆:恐升三級警戒 #基因線上 #新冠肺炎 #Delta變種病毒 #病毒基因定序 #NGS 埃及爸陰轉陽恐是感染源?醫疾呼:解隔政策快修改 10:192021/09/09 生活 埃及爸把Delta帶入台灣?前台大醫曝4劇本網全嚇歪 11:112021/09/09 生活 時論廣場》陳時中3層甩鍋網卡死誰(王任賢) 17:242021/09/09 時論廣場 黃珊珊》Delta病毒來襲北市四大策略因應 09:192021/09/09 生活 Delta讓抗體效果驟降8倍專家:人類恐需要全新疫苗 00:032021/09/09 國際 Mu變種病毒具「免疫逃逸」危險性研究:恐傳播力更強 04:432021/09/09 健康 台灣第一人前中研院院長翁啟惠獲頒威爾許化學獎 03:142021/09/09 國際 害人衰老的基因現形!科學家:修改基因可望長生不老 09:332021/09/09 健康 Delta病毒入侵疫情升溫屏東大學開學改採遠距教學 18:022021/09/09 生活 居隔個案PCR採陰新北13校共5220人明天起復課 17:172021/09/09 生活 「台北只是還沒爆」專家怒批:看不出北市放心的理由 11:242021/09/09 生活 Omicron怎麼發音?魔王級新變種病毒懶人包-健康 我不想失智!快吃這10大食物「護腦」-健康 吃菜也能吃出大肌肉!營養師曝8大高蛋白蔬菜-健康 誰不適合吃燕麥?專家:4種人不宜過量-健康 今日最健康》腰粗也會致命!衍生疾病死亡率已高於癌症-健康 留言規則 中時新聞網對留言系統使用者發布的文字、圖片或檔案保有片面修改或移除的權利。

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