Plasmid extraction | 質體介紹- ACE Biolabs
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Plasmid extraction | 質體介紹 質體(Plasmid)是獨立於宿主染色體DNA的環狀DNA片段, ... 驅動目標基因的轉錄,表達載體的重要組成成分,確認基因於不同細胞類型中表達 ...
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GeneCloning
Plasmidextraction|質體介紹2020/06/03
Plasmidextraction|質體介紹
質體(Plasmid)是獨立於宿主染色體DNA的環狀DNA片段,它們主要存在於細菌中,也自然存在於古細菌和真核生物中,例如酵母菌或是植物,質體向宿主提供一種或是多種功能,有益於宿主,例如對於抗生素的抗性,降解功能或是些許毒性。
(Addgene)
所有天然的質體均包含複製起點(OriginofReplication)(控制質體宿主範圍及拷貝數CopyNumber),以及有利於存活的基因如抗生素抗性基因(Resistantgene),實驗室使用的質體通常是人工產生,將外源DNA導入細菌當中產生,人工質體具有複製起點(Ori)、選擇標記物(如螢光基因、抗性基因)及克隆位點(CloningSite),科學家利用這些特性,修飾質體自我複製的能力,使質體成為生命科學不可或缺的工具之一。
質體包含DNA片段內容
質體內容
於質體內用途
OriginofReplication(ORI)
DNA序列藉著啟動轉錄蛋白,啟動質體的複製
AntibioticResistanceGene
可藉由抗生素基因篩選具有抗性基因的質體
MultipleCloningSite(MCS)
短片段DNA包含多個限制酶位點,可插入DNA(insertGene),於表達質體中,MCS通常位於啟動子下游
Insert
目標基因、啟動子或是其它DNA片段被克隆至MCS中進行進一步研究
PromoterRegion
驅動目標基因的轉錄,表達載體的重要組成成分,確認基因於不同細胞類型中表達以及可獲得重組蛋白的量
SelectableMarker
抗生素抗性基因於細菌中進行選擇,許多質體也具有用於其它細胞類型的抗性基因選擇標記
PrimerBindingSite
短鏈單股DNA序列,用於PCR擴增或測定序起始點,飲物可用於質體的序列驗證
質體複製起點及拷貝數
DNAconstruct(Plasmids)
複製起點(OriginofReplication)
拷貝數(Copynumber)
分類
pUCvectors
pMB1*
500–700
highcopy
pBluescript®vectors
ColE1
300–500
highcopy
pGEM®vectors
pMB1*
300–400
highcopy
pTZvectors
pMB1*
>1000
highcopy
pBR322andderivatives
pMB1*
15–20
lowcopy
pACYCandderivatives
p15A
10–12
lowcopy
pSC101andderivatives
pSC101
~5
verylowcopy
抗生素使用條件及儲存建議
抗生素
建議儲存濃度
建議使用濃度
Ampicillin
100mg/mL
100µg/mL
Carbenicillin
100mg/mL
100µg/mL
Chloramphenicol
25mg/mL(dissolveinEtOH)
25µg/mL
HygromycinB
200mg/mL
200µg/mL
Kanamycin
50mg/mL
50µg/mL
Spectinomycin
50mg/mL
50µg/mL
Tetracycline
10mg/mL
10µg/mL
上述三個表格分別為質體內容,以及不同的複製起點,因應不同的拷貝數,準備相同質體數量情況下,需要增加細菌製備,表三是細菌以及細胞使用抗生素使用濃度及儲存建議,ACEBiolabs也提供相關抗生素化學藥品
ACEBiolabsAntibioticsCatalog#NameAN0001ChloramphenicolAN0002G418DisulfateSaltAN0003PenicillinGsodiumsaltAN0004TetracyclineAN0005KanamycinSulfateAN0006StreptomycinsulfateAN0007BlasticidinShydrochlorideAN0008Puromycindihydrochloride,cellculturetestedAN0010AmpicillinsodiumsaltAN0016Ampicillin
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