系統生物與生物資訊學程 - 國立臺灣大學資訊工程學系

『系統生物學』的主要面向之一是導入系統科學的數學理論與計算模型於生物醫學與生物科技現象之描述上，以建構精確的系統模型，並據以推導更複雜、更高層的生命醫學與生物 ... 參與教學研究單位 電機資訊學院：資訊工程學系、生醫電子與資訊研究所 生物資源暨農學院：動物科學技術學系、生物產業機電工程學系、生物科技研究所(籌備中) 公共衛生學院：公共衛生學系 醫學院：藥學系、醫學檢驗暨生物技術學系、醫學工程研究所 生命科學院：生命科學系 工學院：工程科學及海洋工程學系、醫學工程研究所 參與規劃師資 資訊工程學系：歐陽彥正、高成炎、趙坤茂 電機工程學系：莊曜宇 農藝學系：劉仁沛 動物科學技術學系：林恩仲 植物病理與微生物學系：劉瑞芬 藥學系：林榮信 醫學檢驗暨生物技術學系：李君男 公共衛生學系：陳為堅、李文宗、蕭朱杏 生命科學系：阮雪芬 生物產業機電工程學系：周瑞仁、陳倩瑜 醫學工程研究所：陳中明 工程科學及海洋工程學系：黃乾綱 設置宗旨 臺灣大學自90學年度起即設立『生物資訊學程』，並致力延攬優秀師資以充實相關課程的開授。

近年來合計新聘『生物資訊』領域教師7位(包括資訊工程系趙坤茂教授、農藝學系劉仁沛教授、電機工程學系莊曜宇副教授、藥學系林榮信助理教授、生命科學系阮雪芬助理教授、動物科學技術學系林恩仲助理教授、以及生物產業機電工程學系陳倩瑜助理教授)。

加上原有師資計有7位投入『生物資訊』領域教學與研究工作(包括資訊工程學系高成炎、歐陽彥正兩位教授、公共衛生學系陳為堅、李文宗、蕭朱杏三位教授、醫學工程研究所陳中明教授、生物產業機電工程學系周瑞仁教授)。

因此已組成包括14名成員陣容之堅強之團隊。

以94學年度為例，合計開授生物資訊相關課程計23門共60學分(含暑期課程)。

基於前述的基礎與本校之特色，以及未來系統生物學發展趨勢，擬提案自94學年度起將現有『生物資訊』學程重組為『系統生物與生物資訊學程』。

『系統生物學』的主要面向之一是導入系統科學的數學理論與計算模型於生物醫學與生物科技現象之描述上，以建構精確的系統模型，並據以推導更複雜、更高層的生命醫學與生物科技現象之運作原理，並進一步與以實驗為基礎之生命醫學與生物科技研究相互搭配，創造生命醫學與生物科技研究更寬廣的進步空間。

就這個面向而言，由於臺灣大學是一所綜合性大學，在生命醫學與生物科技領域計有醫學院、生物資源暨農學院、公共衛生學院、生命科學院等4個學院，理工領域則有理學院，工學院，電機資訊學院等3個學院。

科系完整，陣容堅強，具備發展計算系統生物學的優越條件。

除『系統生物學』領域課程外，由於臺灣大學『結構生物資訊學』的研究團隊近年來已研發成功數個軟體。

這幾個軟體的原理均發表於NucleicAcidsResearch(SCIimpactfactor7.)及Bioinformatics(SCIimpactfactor5.)等生物資訊領域最重要的期刊上。

由此可見台灣大學的團隊在『結構生物資訊學』領域已具備國際一流水準的實力以培養最尖端的生物科技研發人才。

未來更將以「分子結構分析與模擬」、「藥物基因體學」、「藥物動力學模擬」作為重點發展方向。

至於『醫學生物資訊學』方面，台灣大學原本即擁有一流的臨床醫學教學與研究團隊，與校內生物資訊學團隊充分合作更能針對「疾病基因圖譜建構」、「仿生醫學」等主題建立一支極具特色的教學與研究團隊。

此學程以醫學院、生農學院、電資學院、公衛學院、生命科學院、工學院之學生為主要對象，並對其他學院之學生開放。

學程行政工作將由『生物技術研究中心』負責。

申請修讀資格 本校在學學生，修習通過本學程預修課程者，得申請修習本學程。

申請及審核程序 本學程於每學期甄選一次，學生須向本學程中心索取申請表，並檢附歷年成績單一份，經所屬系所之主管同意後，於該學期加退選日開始之前三週，將申請表及歷年成績單送至本學程中心（逾期不受理），由本學程委員會審核後，於加退選截止前一週公布核准名單。

修畢並通過本學程規定之20學分以上，由本校授與「系統生物與生物資訊學程」修習證明書。

學程規劃綱要 『系統生物與生物資訊學程』的規劃強調培訓跨領域之人才。

因此，在學程的基礎課程設計上針對理工背景同學開授「生物化學」必修課。

而針對生醫農背景同學則開授「系統生物數學」必修課。

共同必修則包括「生物資訊學」及「系統生物學」兩門課。

基礎課程合計3門課至少6學分。

本學程之核心課程與特別課程則分為2個主軸「系統生物學」以及「生物資訊學」。

修習本學程同學可選擇其一選修，核心課程至少3門課合計8學分以及特別課程至少2門課合計6學分完成學程。

整體學程規劃請見下表。

預修課程(不計學分) 普通生物學或相關課程 計算機概論、程式設計或計算機相關課程 微積分 基礎課程(必修3門課、至少6學分) 生物資訊學或相關課程 系統生物學 系統生物數學(生醫農背景同學) 生物化學或相關課程(理工背景同學) 核心課程(選修至少3門課、8學分以上) 系統生物學主軸 生物資訊學主軸 系統生物學專題討論 結構生物資訊學 基因網路重建演算法 生物統計學或相關課程 生物晶片技術概論 結構生物學概論 生物資訊軟體設計實習 生物資訊學演算法 生物資訊學演算法 生物序列分析演算法 生物資訊軟體原理與應用 計算藥物學概論 生物資訊學軟體應用 生物資訊學之統計與計算方法 生物統計學或相關課程 生物晶片技術概論 生技產品統計方法 生物資訊軟體設計實習 分子生物學或相關課程 流行病學 遺傳學或相關課程 遺傳流行病學原理 分子演化學或相關課程 生理學或相關課程 基因體學或相關課程 功能基因體學或相關課程 蛋白質體學或相關課程 細胞生物學 特別課程(選修至少2門課、6學分以上) 系統生物學主軸 生物資訊學主軸 生物技術核心實驗 計算藥物學 蛋白質間交互作用 生醫資料探勘演算法 基因晶片方法與數據分析 臨床藥品動態學 生物系統鑑別 藥物基因體學 生態模擬之理論與實習 生物資訊學特論 數學模擬與系統生物學 基因晶片方法與數據分析 生物檢定統計法 基因體統計學 基因體統計學 複雜性疾病之基因圖譜建構 生物系統模擬與分析 生物晶片技術(含實驗) 基因表現與功能分析(含實驗) 細胞凋亡及流式細胞儀技術(含實驗) 生物晶片技術(含實驗)