gRNA Plasmid(質體建構)-CRISPR Services (基因編輯服務)
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載體類型除了送入細胞方式的不同(慢病毒、轉染或AAV 系統),還有不同的作用方式(圖一)。
除了最初發現的Cas9 造成DNA 雙股斷裂(DSB) 之外,後來科學家們還研究出DNA 單股 ...
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CRISPRServices(基因編輯服務)
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gRNAPlasmid(質體建構)
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將設計好的gRNA接入特定載體,提供最方便的gRNA庫存質體,也能由客戶自行提供gRNA序列,並選擇適合的載體,由GenScript完成質體建構。
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詳細內容
CRISPR被稱為第三代基因編輯技術,相較於先前的TALEN與ZFN系統而言,CRISPR操作更簡單,且成功率更高。
ClusteredRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeats(CRISPR)andCRISPR-associatedprotein(Cas)為細菌特殊的免疫系統,保護細菌免受病毒感染。
CRISPR技術是由Cas9蛋白質透過gRNA和目標基因的鹼基配對互補性,專一性結合目標基因染色體DNA,並進行雙股裁切(doublestrandbreak,DSB)。
而發生DSB的染色體會以兩種方式修復,NHEJ(non-homologousendjoining)容易造成基因功能缺失(knockout),而HDR(homology-directedrepair)引入ssDNAtemplate則可以插入或置換特定序列(knockin)。
鹼基配對的特性使得CRISPR專一性更高,操作和設計更簡單,因此被廣泛應用於基因工程領域。
GenScript提供CRISPRplasmid質體建構服務,讓您快速拿到CRIPSR工具。
一、服務介紹
GenScript和張鋒實驗室共同合作(FengZhang’slaboratoryattheBroadInstituteofMITandHarvard),免費提供gRNA資料庫,並且超過20,000條gRNA已建構成庫存質體(載體為pLentiCRISPRv2,SpCas9系統、慢病毒表現系統),可以直接購買快速到貨。
同時,客戶也能提供自行設計或文獻中的gRNA序列,並選擇不同的載體,由GenScript完成質體建構。
載體類型除了送入細胞方式的不同(慢病毒、轉染或AAV系統),還有不同的作用方式(圖一)。
除了最初發現的Cas9造成DNA雙股斷裂(DSB)之外,後來科學家們還研究出DNA單股斷裂(SSB)和促進基因表現(SAM)的特殊Cas9,GenScript提供五種Cas9系統供客戶選擇(表一)。
(完整載體資訊請點選此連結)
(GenScript亦提供human和mouse全基因的gRNA質體圖庫,請點選此連結)
圖一:三種Cas9作用方式,(a)最初的CRIPSR作用方式,造成染色體DNAdoublestrandbreak(DSB),引發NHEJ。
(b)特殊突變Cas9n,只能造成染色體DNAsinglestrandbreak(SSB),需要同時有兩個位點作用才能引發NHEJ,造成DNA缺失。
(c)特殊去活性Cas9(dCas9),不會造成DNA斷裂,而是攜帶活化因子促進特定基因表現(synergisticactivationmediator,SAM)。
表一:五種Cas9系統比較
系統名稱
*作用方式
應用
說明
SpCas9
DSB
一般使用
最早應用於基因編輯的CRISPR系統,來自於S.pyogenes的typeIICRISPR系統。
eSpCas9
DSB
Off-Target較低
為SpCas9經過三個點突變(K848A,K1003A,R1060A),可以減少non-targetDNA的結合,大幅提高專一性。
SpCas9Nickase(Cas9nD10A)
SSB
使用上必須同時引入兩段gRNA,Off-Target較低
為SpCas9經過一個點突變(D10A),此突變會導致Cas9只能進行單股核酸裁切(SSB)。
使用上必須同時引入兩段gRNA,辨認鄰近的區域(需要是DNA雙股各一股),造成兩個鄰近的單股DNA斷裂,才能夠引發NHEJ,造成基因缺失,因此可以大幅度降低off-target,增加專一性。
SaCas9
DSB
Cas9蛋白質較小,AAV包裝專用
來自於Staphylococcusaureus,作用效率和SpCas9差不多,但是SaCas9蛋白質較小(少1kbDNA),較適合Adeno-AssociatedVirus(AAV)包裝。
TranscriptionActivation(SAM)Plasmids
SAM
去除活性的Cas9(dCas9),接上Transactivationprotein,用來專一性地促進特定基因表現
為特殊的CRISPR系統,其中Cas9透過突變而失去核酸裁切的功能(dCas9),同時又接上transactivationprotein(VP64),sgRNA也經過特別設計(加上twoMS2RNAaptamers),用來專一性地促進特定基因表現。
*DSB,DNAdoublestrandbreak;SSB,DNAsinglestrandbreak;SAM,synergisticactivationmediator.
二、服務應用
1.針對目標基因做knockin或knockout:
SpCas9,eSpCas9,SpCas9nickase,SaCas9皆能夠造成DNA雙股或單股斷裂,其中SaCas9適用AAV系統,而SpCas9nickase只能造成DNA單股斷裂,比較資訊請參考表一。
2.針對目標基因促進基因表現:
SAM系統不會造成DNA損傷,失去活性的Cas9蛋白質會帶著transactivationprotein,因此反而會促進基因表現,比較資訊請參考表一。
三、服務優點
1.免費gRNA資料庫:
GenScript和張鋒實驗室共同合作(FengZhang’slaboratoryattheBroadInstituteofMITandHarvard),免費提供gRNA資料庫,資料庫中的gRNA序列皆已經過驗證,能夠有效地針對目標基因,讓您放心做選擇。
(免費gRNA資料庫請點選此連結)
2.提供gRNA庫存質體,最快一週到貨:
原廠提供超過20,000條gRNA庫存質體(預設載體為pLentiCRISPRv2),下訂後可於一週到貨。
3.多種Cas9系統選擇:
五種Cas9系統選擇,SpCas9,eSpCas9,SpCas9nickase,SaCas9,SAM,對應三種作用方式(表一)。
4.多種載體型式可選擇:
多種載體型式可選擇[轉染用、慢病毒系統[all-in-one或dualvector(gRNA和Cas9分開]、AAV系統](完整載體資訊請點選此連結)。
四、服務方案
1.客戶提供:
(1)基因名稱(Genesymbol/ID)orgRNA序列
(2)指定載體
2.出貨規格:
(1)4ug凍乾質體
(2)定序結果
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