課程大綱

七、課程目的： 功能基因體學整合了遺傳學、生物化學、分子生物學、細胞生物學及其他相關科學而成之新興科學。

近來，許多重要物種之基因體已（將）完成定序工作，如何在 ... 課程資訊 課程名稱 作物功能基因體學導論INTRODUCTORYCROPFUNCTIONALGENOMICS  開課學期 95-1  授課對象 學程 生物產業自動化學程  授課教師 常玉強  課號 Agron5034  課程識別碼 621U6220  班次   學分 2  全/半年 半年  必/選修 選修  上課時間 星期三3,4(10:20~12:10)  上課地點 農藝108  備註 限學士班四年級以上總人數上限：30人    課程簡介影片   核心能力關聯 核心能力與課程規劃關聯圖 課程大綱 為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印 課程概述 一、課程簡介: 農藝系九十三學年度第一學期課程 一、課程名稱：作物功能基因體學導論 IntroductoryCropFunctionalGenomics 二、開課時間：每星期三（3、4節） 三、授課教師：常玉強助理教授 四、學分數：2學分 五、修課對象：大學部四學生及研究生或已先修習生物化學、遺傳學或分子生物學之大三同學，其他同學請先與開課老師聯絡 六、教科書：自編講義 七、課程目的： 功能基因體學整合了遺傳學、生物化學、分子生物學、細胞生物學及其他相關科學而成之新興科學。

近來，許多重要物種之基因體已（將）完成定序工作，如何在龐大的DNA資訊中鑑定（並選殖）出有功能之基因是未來重要的工作，此即功能基因體學。

由於功能基因體學為一新學問，目前並無相關教課書。

雖然「MethodsinMolecularBiology」系列於2003年八月出版一本「Plantfunctionalgenomics」，惟該書內容由個別專業之教授各自負責某一章節集結而成，並不適合作為大學生或研究生入門之教科書。

因此授課老師自編一份講義，針對生物相關領域的學生（曾修過遺傳學或分子生物學）作一入門之介紹。

由於授課內容常牽涉性狀之描述，因此講義以彩色powerpoint圖檔型態表達。

八、課程大綱及進度： 授課內容簡介：第一章簡介後，課程主要分兩部分：第二章至第九章針對植物單一功能基因之各種研究，第十章至第十三章則擴展至基因與基因之間之相互作用之各種研究。

一開始針對單一基因，第二章『Howtocloneaplant/cropgene』介紹如何研究有興趣性狀所負責之基因（序列），其後介紹新興之方法—GeneTagging技術，及其所衍生之許多新方法如：Genetrapping、Activationtagging。

並介紹這些技術在順向/逆向遺傳學（Forward/ReverseGenetics）上之應用。

而第七章『Mutantsscreening』則蒐集十年來所有相關文獻，以學生較易理解之方法為出發點（假設學生執行該項工作所需之工作量），整理出四小時授完約百篇文獻之內容。

其後配合第八章電腦網路之資源之介紹，傳達網路資源對功能基因體學研究之重要性。

最後第九章『Howtoidentifyaplant/cropgene』介紹獲得功能基因（之序列）後，仍需進一步印證；與第二章前後呼應。

第二部分則針對了解個別基因後，尚需了解基因與基因之間相互調控，才能支撐龐大的生命現象。

第十章至第十三章分別以性狀、mRNA、蛋白質及代謝化合物為平台研究功能基因間之相互關係。

最後第十四章比較動物相關之功能基因體學研究作為結束。

如有疑問請洽校內分機4118或 e-mail:[email protected] 每週兩小時，一學期十八週，各週教學主題如下： 9/15 Chap1.Introduction:genomeandgenomesize 9/22 Chap2.Howtocloneaplant/cropgene 9/29 Chap3.Functionalgenomics&genomesequencingprojects 10/6 Chap4.Forwardandreversegeneticapproachestogenefunction 10/13 Chap5a.Genetaggingandtrapping 10/20 Chap5b.Strategiesforgenetagging 10/27 Chap6.PCR,inversePCRandTAILPCR 11/4 Quiz 11/10Chap7a.Mutantscreening 11/17 Chap7b.Mutantscreening 11/24 Chap8.NCBIblastforT-DNAflankingregion 12/1 Chap9.Howtoidentifyaclonedgene:complementation,targeting 12/18 Chap10.Phenomics:phenotypicprofilingofmutantcollections 12/15 Chap11.Transcriptomics:geneexpressionanalysisbymRNAprofiling 12/22 Chap12.Proteomics:analyzingtheplantproteome 12/29 Chap13.Metabolomics:profilingthecompositionofmetabolites 1/5 Chap14.Functionalgenomicsstudyinanimalsystem 1/12 Quiz Chap15.Planttransformation&transformantsanalysis  課程目標   課程要求   OfficeHours   參考書目   指定閱讀   評量方式(僅供參考)     課程進度 週次 日期 單元主題 無資料